
| 番号 | ミッション名 | 敵陣営 | トレジャー | 他解禁事項 |
| 1 | 月面での逃走劇 | 地球連合軍 | No.1 戦闘宙域に漂う箱 No.2 逃亡者の烙印 | 部隊「ハーディー隊」 ギャラリー「No.39 反乱軍の旗手」 |
| 2 | 地球への降下 | グランゼーラ革命軍 | No.3 上空で漂うデータ | ユニット「ストライダー」 |
| 3 | 南の海での異変 | バイド軍 | No.4 バイドに関するメモ1 | 部隊「ホルバイン隊」 ギャラリー「No.61 流体金属の恐怖」 |
| 4 | 雨の山岳地帯で | 地球連合軍 | No.5 工作機の残骸 No.6 エマからの依頼 (クリア後) | 部隊「ヤナーチェク隊」 ユニット「エクリプス試作型」 |
| 5 | 始動!基地建設システム | 地球連合軍 | No.7 基地戦のデータ | 艦長「イプセン艦長」 ユニット「ニーズヘッグ級」 |
| 6 | 紅の空 | 地球連合軍 | No.8 人型兵器の研究データ No.9 革命軍司令官の意志 (クリア後) | 艦長「オニール艦長」 部隊「ノグチ隊」 ユニット「ヴァナルガンド級」 |
| 7 | メインベルトでの遭遇戦 | 地球連合軍 | No.10 亜空間ソナー | - |
| 8 | 灼熱の衛星イオ | 地球連合軍 | No.11 白兵戦強化武装 No.12 加速可変システム (クリア後) | 部隊「マーロー隊」 ユニット「エクリプス実戦配備型」 ギャラリー「No.56 亜空間狩り」 |
| 9 | 木星の大気の中で | バイド軍 | No.13 バイドに関するメモ2 | - |
| 10 | 水と氷のエウロパ | 地球連合軍 | No.14 水中制御システム | - |
| 11 | 土星の環の基地戦 | 地球連合軍 | No.15 遠隔亜空間バスター No.16 不確かな情報 (クリア後) | 艦長「パラキレフ艦長」 部隊「ペケット隊」 ギャラリー「No.36 突き抜ける弾丸!」 |
| 12 | 要塞ゲイルロズ攻略作戦 | 地球連合軍 | No.17 浮遊コンテナ No.18 宇宙空母の設計思想 No.19 命令書 (クリア後) | 部隊「キルヒナー隊」 ギャラリー「No.62 宇宙要塞ゲイルロズ攻略戦」 副官「ラウ」 |
| 13 | バイドの群れ | バイド軍 | No.20 機体軽量化素材 | - |
| 14 | 土星の生ける悪夢 | バイド軍 | No.21 超硬度パイルの実用化 No.22 ドブケラバスター(クリア後) | ギャラリー「No.58 グランゼーラの副官たち」 ページデザイン「システム手帳」 |
| 15 | 待ち伏せ艦隊 | 地球連合軍 | No. | |
| 16 | 衛星オペロン動乱 | ????軍 | No. | |
| 17 | 氷の星-天王星 | バイド軍 | No. | |
| 18 | 彗星の出ずる処 | 地球連合軍 | No. | |
| 19 | 時速2000kmの風 | 地球連合軍 | No. | |
| 20 | カイパーベルト(迂回ルート) | 太陽系開放同盟軍 | No. | |
| 21 | カイパーベルト(直行ルート) | 太陽系開放同盟軍 | No. | |
| 22 | グリトニル攻略戦 | 太陽系開放同盟軍 | No. | |
| 23 | 突入!グリトニル | 太陽系開放同盟軍 | No. |